Io da un cliente ho fatto semplicemente un sezionale, finta banca, dove
viene usato un conto denominato "compensazione reverse" che viene usato
per pagare solo parte di iva della fattura acquisto.
Quando viene emessa l'auto fattura uso come conto imponibile lo stesso
conto compensazione (ho fatto creare un prodotto autofattura) che poi
azzero pagando la fattura sul sezionale di cui sopra.
Tutto quadra e non ho dovuto fare nessuna modifica al codice ed il
cliente non fa giri strani ma riprende esattamente quello che molti
commercialisti fanno fare.